科学研究发现，附着在农作物的根、径、叶表面及其体内的微生物有近千种甚至更多，这些微生物绝大部分无害，其中很多对农作物有益，只有少数微生物是病原菌，反之，我们的环境将变成很可怕，后果也会不堪设想。
农作物能够与有益菌建立协作共生的关系。以菌根真菌举例，这些真菌与农作物形成共生关系，根系分泌物为其提供部分养分，真菌在作物根系表面生成一层菌膜，这极大地保护了根系免遭病原菌侵染，真菌的分支很长，可以为根系提供充足的养分。
正常情况下，健康的农作物处于有益菌占据主导地位的微生物环境下，有益菌通过竞争食物和空间限制病原菌的生长，有些有益菌的分泌物可以直接抑制甚至杀灭病原菌。
在恶劣的环境条件下，病原菌才会侵染泛滥，尤其是农作物生存的土壤环境比较差时，根系发育不良，整体不健康，微生物平衡被破坏，这时根系最容易受到侵染。我们利用有益微生物可以构建对作物有益的环境，大大减少病虫害，减少农民的烦恼。
坤益健产品内富含的枯草芽孢杆菌具有较强的竞争和定殖能力，从而抢占病原菌的侵染位点，消耗其周围养分，阻止和干扰病原菌对植物叶面和其他器官的侵染，起到防病抑菌的作用。其产生的代谢产物在低浓度下就能够对病原微生物的生长和代谢产生抑制作用，从而来影响病原微生物的生存和活动。枯草芽孢杆菌通过吸附在病原菌的菌丝上，并随着菌丝生长而生长，而后产生溶菌物质造成原生质泄露使得菌丝体断裂，致使细胞壁穿孔、畸形等现象从而抑制孢子萌发。还能够诱发植物自身抗病机制从而增强植物的抗病性能的作用。
坤益健含的高活性胶冻样芽胞杆菌富含的有效、活性的胶冻样芽孢杆菌，它可在土壤中繁殖生长，并产生有机酸、荚膜多糖等代谢产物，破坏硅铝酸盐的晶格结构、难溶性磷化合物等，分解释放出可溶的磷钾元素及钙、硫、镁、铁、锌、钼、锰等中微量元素，既增进了土壤肥力，又为作物提供了可吸收利用的营养元素，同时产生赤霉素、细胞激动素、微生物酶、细菌多糖等生理活性物质，促进作物营养吸收和生长代谢。
坤益健有效菌给土壤补入大量有益微生物，在作物根部形成有益菌群，有效抑制土壤有害和致病微生物的繁殖，显著减少多种土传病害的发生，如葡萄的白粉病、番茄立枯病、黄枯萎病等。从而减少部分农药的使用，减轻农药污染。枯草芽孢杆菌、解淀粉芽孢杆菌等产生的抗菌物质对引起重茬的镰刀菌、丝核菌都有明显抑制作用。
